如何评估CRISPR文库的质量？_常见问题

Scishare成立的初衷是什么？

2021年，几个海外归国的青年学者一起讨论基因功能研究的手段时，一致认为功能性筛选（批量敲除、敲低或过表达）相对于相关性筛选（各种组学测序）具有明显优势，相关性筛选拿到的基因不一定有功能，而功能性筛选还能在一定环境下对基因功能进行排序，可能发现未知基因功能强于已报道的明星基因。对于国内科学家而言，获取用于功能性筛选的CRISPR文库并不容易，于是我们决定成立一个国人自己的质粒文库共享平台Scishare，将“以科学的方式分享科学”作为宗旨，以公益性质分享CRISPR文库给国内的学者们使用。
Scishare文库是否有自主知识产权？

是的。Scishare独特的优势在于我们的发起人具备极强的文库构建能力，在平台成立之初就非常注重知识产权的保护，平台分享的所有文库均由Scishare自主构建或者基于公开发表信息重建。因此，我们在分享CRISPR文库时秉承“以科学的方式分享科学”的理念，以公益形式分享给大家，让大家在知识产权上无后顾之忧。
Scishare的主要优势有哪些？

（1）可用性强：其它平台大多提供1ug质粒，需要进行文库的扩繁和二代测序质控，耗费时间长，过程中很容易造成文库质粒丢失和平衡性变差，从而影响实验结果。而Scishare文库进行了严格质控，并提供多种规格质粒包装满足申请者不同需求；
（2）质控严格：所有文库质粒覆盖度均>99.9%，均一性<6;
（3）发货周期短：因为海关和进口的问题，其它平台到货时间很久，Scishare可以承诺现货文库3个工作日发货，非现货文库7个工作日发货；
（4）费用低：其它平台文库需要支付文库费用、手续费、邮寄费，后期扩繁文库还需要文库扩增费用，而Scishare只收取文库费用。
（5）MTA签署简单：Scishare只需签署后的MTA发送至PI邮箱确认即可，无需审批，手续简便；
（6）付款方式灵活：Scishare文库是发货同时开具发票，客户可以收到文库后再报销。
如何评估CRISPR文库的质量？

一个好的CRISPR文库通常由覆盖度（coverage）和平衡性（balance）两个维度来判断其质量：
（1）文库覆盖度表示gRNA是否存在丢失现象，通常99%覆盖度可认为文库质量合格；
（2）评估文库平衡性的第一个指标是sk比值（skew ratio）= 累积分布达到90% gRNA数目时对应的count数/累积分布达到10% gRNA时对应的count数，一般sk小于10认为文库平衡性可接受；
（3）评估文库平衡性的另一个指标是AUC曲线，用所有gRNA count数绘制一个累加曲线，用曲线下面积来反应文库质量，一般AUC小于0.7认为文库平衡性可接受。
我们发起的Scishare共享平台所有CRISPR文库质粒都经过严格的质控，均满足以上三个指标。
如何签署材料转让协议（MTA）？

材料转让协议（Material Transfer Agreement，MTA）是一项管理科学材料转让的法律协议。它为Scishare存储库中的材料提供知识产权保护，并确保接收科学家和接收组织在使用所请求的材料时同意Scishare相应条款。Scishare存储库中的大多数项目都需要MTA的批准。MTA可以由课题组学生、科研助理或秘书代为准备，签署课题组组长（PI）电子签名，订购时通过抄送邮件至PI邮箱的方式确认。Scishare保留审查和拒绝MTA的权利。有关MTA签署过程的更多详细信息，请参阅我们的订购流程页面。